По мере совершенствования на практике ученики изучают курс «Вторая ступень РЭЙКИ», где овладевают возможностями: проводить полные и краткие сеансы с помощью символов; усиливать РЭЙКИ универсальную жизненную силу, здесь, сейчас, на этом месте, проблеме, ситуации; работать на дистанции без непосредственного контакта с человеком, проблемой, ситуацией; проводить энергетическую чистку помещений и открытых пространств.
Подготовка и обучение мастеров РЭЙКИ предполагает 2 этапа: Мастер-Целитель 3-я ступень и Мастер-Учитель, что также происходит через определенный интервал времени. После практической работы и стажировки ученика II ступени, проверки теоретических и практических знаний, проверки готовности его быть Мастером-Целителем РЭЙКИ, проводится инициация III ступени, с передачей символов и методик работы. В последствии Мастер-Целитель РЭЙКИ может пройти стажировку, обучение и инициацию с присвоением звания Мастера-Учителя РЭЙКИ и получением способности передачи силы РЭЙКИ другим.